مركز ضمان الجودة بجامعة 6 أكتوبر يعمل على تنفيذ وتطوير نظام متكامل للدعم الفني والمراجعة الداخلية والتقييم المؤسسي والتعليمي الشامل والمستمر بما يحقق رؤية ورسالة الجامعة، ويضمن تطوير المنظومة التعليمية بها، و اكتساب ثقة المجتمع في خريجي الجامعة، وذلك في إطار من الاستقلالية والحيادية والشفافية ووفقاً للمعايير القومية للتقويم المؤسسي.